生命の「働く分子」であるタンパク質の構造と機能の研究には、多大な時間とリソースの投入が必要です。しかし、AI技術の導入により、この状況は根本的に変化しました。ディープラーニングモデルを用いることで、研究者はタンパク質の立体構造を迅速に予測し、新たな機能性タンパク質を設計し、さらには遺伝子と疾患の隠れた関連性を明らかにすることさえ可能になりました。この革新的なブレークスルーは、世界中の資本から強い注目を集めるだけでなく、多くのスタートアップ企業がAI主導のタンパク質科学分野で競争し、協力するきっかけにもなっています。

このコンペティションにおいて、Generate: Biomedicines（以下、Generate）はAIタンパク質研究分野のリーダーとして際立っていました。2018年に設立されたこのテクノロジー主導のバイオメディカル企業は、独自のプログラマブル生物学プラットフォームを通じて、人工知能をタンパク質工学に深く統合するだけでなく、従来は創薬が困難であった標的に対するより効率的なソリューションを科学者が設計するのを支援しています。

2024年12月18日、GenerateはSamsung Science & Life Fundからの戦略的投資を発表し、再び業界の注目を集めました。具体的な金額は明らかにされていませんが、その意義は明白です。また、 GenerateがCNBCの「2024 Disruptor 50」リストに選出され、AIタンパク質研究分野における「ダークホース」となったことも注目に値します。

生成: バイオメディシン公式ウェブサイト:
https://generatebiomedicines.com/

Generateは電子メールから生まれました。

GenerateはベンチャーキャピタルのFlagship Pioneeringによって設立され、米国マサチューセッツ州に本社を置いています。最初の2年間は、プログラム可能な生物学の基礎研究に注力し、独自のコンセプトを徐々に形にし、2020年9月に正式に立ち上げられました。

同社の共同創設者であるゲヴォルグ・グリゴリアン博士は、タンパク質の構造と機能の研究を専門とする計算生物学者です。Generateを設立する前は、ダートマス大学でタンパク質の構造と機能の研究に従事していました。

当時、彼はデータ駆動型アプローチを用いた治療用タンパク質の設計という革新的なアイデアを模索していましたが、この科学的概念をいかにして実現可能なビジネスに転換するかに苦慮していました。この問題を解決するため、彼はMIT博士課程で受講した起業家精神に関する講義のシラバスを掘り起こし、かつてのメンターであるヌーバー・アフェヤンにメールを送ることにしました。当時、アフェヤンはFlagship Pioneeringの共同創業者兼CEOであり、世界的なバイオテクノロジー革新のリーダー的存在でした。

Generateの共同創設者、ゲヴォルグ・グリゴリアン博士

グリゴリアンは何時間もかけてメールを丹念に書き上げ、ついに早朝に送信しました。そしてわずか15分後、アフェヤンから返信が届きました。この一見偶然の出会いが、Generate誕生の礎となりました。アフェヤンの指導の下、グリゴリアンのアイデアは急速に支持を集め、より多くの科学者や投資家を引きつけました。そして最終的に、グリゴリアン、アフェヤン、そして他のコアチームメンバーがGenerateを共同設立しました。

現在、グリゴリアン氏は同社の共同創業者兼CTOを務めており、もう一人の共同創業者はモリー・ギブソン氏です。モリー氏はFlagship Pioneeringの創設パートナーでもあることは特筆に値します。

Generateの共同創設者、モリー・ギブソン

創業以来、Generate は独自のテクノロジー プラットフォームとビジネス モデルにより、資本市場から高い評価を受けています。

同社は2020年9月にFlagshipから5,000万ドルのシード資金を確保し、2021年11月には3億7,000万ドルのシリーズB資金調達ラウンドを完了しました。さらに2023年9月には、2億7,300万ドルを超えるシリーズC資金調達ラウンドを完了し、総投資額は約7億ドルに達しました。このラウンドには、NVIDIA、Amgen、Mirae Asset Managementといった一流機関投資家が参加し、Generateのプロジェクト開発に確かな財務基盤を提供しました。

治療効果のある新しいタンパク質分子を設計するためのクロマモデルを開発します。

従来の製薬会社とは異なり、Generate の主な目標は、自然界にすでに存在し治療効果が期待できるタンパク質を発見することではなく、むしろ自然界にこれまで存在したことがなく治療効果が期待できるまったく新しいタンパク質の設計と製造に重点を置くことです。

この目標を達成するために、Generateは独自のGenerativeプラットフォームを構築しました。このプラットフォームは、「生成、構築、測定、学習」という循環型モデルを採用しており、標的の発見から治療設計に至るまで、同定と検証のスピードと効率を大幅に向上させます。

生成プラットフォームの動作モード

このプラットフォームを用いて、 Generateは自然界には存在しない100万種類以上のタンパク質の作製に成功し、クライオ電子顕微鏡法とウェット実験を用いてその機能を検証しました。例えば、Generateが設計した緑色蛍光タンパク質（GFP）は、従来の設計に比べて50倍の性能向上を実現しています。

この研究分野は、2023年11月にGenerateが生成AIモデル「Chroma」をNature誌に発表したことで大きな飛躍を遂げました。Chromaは、タンパク質の配列、構造、機能の関係性を推測することで、科学者に全く新しい設計ツールを提供します。

論文の宛先:
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06728-8

実験により、Chroma によって生成されたタンパク質は優れた生体物理学的特性を持つだけでなく、in vitro および in vivo 実験を通じてその治療効果が実証され、前臨床試験で極めて高い安定性と機能性を示すことが示されています。

さらに重要なのは、生成生物学の発展を加速するために、Generate が Chroma モデルをオープンソース化したことです。

Chromaモデルのオープンソースアドレス:
https://github.com/generatebio/chroma

Generateは、生成生物学が生成AIによって推進される医薬品開発における根本的な転換点となると考えています。このアプローチは天然タンパク質への依存から脱却し、科学者が現在および将来の治療ニーズに対応する全く新しい分子を設計することを可能にします。これにより、プログラム可能な医薬品の時代が加速し、医薬品開発の迅速化、低コスト化、柔軟性の向上が実現し、世界中の患者にさらなる希望をもたらします。

ノバルティスやアムジェンなどの大手製薬会社と提携し、複数の医薬品開発パイプラインを構築

Generate 社は、自社製品を社内で開発するだけでなく、「密室での作業」にとどまらず、相互利益を追求するために世界有数の製薬会社やバイオテクノロジー大手と積極的に協力しています。

2022年1月、 Generate社はアムジェン社と、5つの臨床標的を標的としたタンパク質療法の開発に関する共同研究契約を締結しました。共同研究の一環として、アムジェン社は5,000万ドルの初期投資を行い、共同研究全体の総額は19億ドルに達する可能性があります。さらに、Generate社はロズウェルパークがんセンター、MDアンダーソンがんセンターなどとも共同研究を行い、タンパク質療法およびCAR-T療法の開発を進めています。

2024年9月、 Generateはノバルティスと複数の疾患領域にわたるタンパク質治療薬の共同開発に向けたマルチターゲット提携を発表しました。ノバルティスはGenerateに対し、Generateの株式取得費用1,500万ドルを含む総額6,500万ドルの前払い金を支払いました。Generateは、最大2桁の段階的ロイヤルティに加え、ノバルティスから10億ドルを超える業績連動型マイルストーンペイメントを受け取る権利も有しています。

パイプラインを生成する

現在、Generate社は腫瘍学、免疫関連疾患、感染症を網羅する豊富なパイプラインを構築しています。喘息治療薬TSLPモノクローナル抗体GB-0895と新型コロナウイルス感染症（COVID-19）のPrEP治療薬GB-0669を含む2つの候補薬が第I相臨床試験に入っています。

結論は

Generateは、生成AIを用いてタンパク質科学と医薬品開発の未来を再定義します。タンパク質設計から臨床試験まで、同社は独自の技術力と卓越した実行力を発揮しています。

バイオメディカル分野における AI の浸透が進むにつれ、Generate は「オンデマンドでタンパク質を設計する」というビジョンを現実のものにし、より柔軟で効率的、かつ正確な医薬品開発の時代を先導し、患者と世界の健康分野に大きな影響を与えると期待されています。

参考文献:

1.https://www.morningstar.com/news/pr-newswire/20241218cn82369/samsung-invests-in-generate-biomedicines-to-advance-ai-driven-protein-therapeutics-discovery

2.https://www.biospace.com/press-releases/generate-biomedicines-announces-multi-target-collaboration-with-novartis-to-discover-and-develop-protein-therapeutics-with-generative-ai

3.https://www.cnbc.com/2024/05/14/generate-biomedicines-cnbc-disruptor-50.html

4. https://news.mit.edu/2024/creating-crossroads-gevorg-grigoryan-0628

5.https://www.ourcrowd.com/startup/generate-biomedicines